L’Assemblée Générale constitue l’organe suprême de l’AGFIS. De 1985 à 2002 elle a été précédée par le Congrès annuel de l’AGFIS, qui était chargé d’étudier des thèmes précis. Depuis 2003, l'Assemblée Générale se tient en avril / mai pendant la Convention Internationale de Sports, SportAccord, qui est organisée par l’AGFIS en collaboration avec l’Association des Fédérations Internationales Olympiques d’Eté (ASOIF) et l’Association des Fédérations Internationales Olympiques de Sports d’Hiver (AIOWF).

Une exposition et des conférences sont organisés dans le cadre de cet événement, en même temps que les réunions institutionnelles des Fédérations Internationales et du Comité International Olympique.